Untuk meningkatkan kualitas sebuah perguruan tinggi, harus ada  Audit Mutu Internal (AMI). Dalam prakteknya segala bidang akademik maupun non akademik yang terlaksana di Perguruan Tinggi itu  harus sesuai dengan standar SPMI (Sistem Penjaminan Mutu Internal) yang telah ditetapkan. Untuk STIKAS St Yohanes Salib (SYS) hal ini baru saja memulai siklus yang kedua pada tanggal 5 Februari – 15 Maret 2024, yang dilakukan oleh 4 orang Auditor bersertifikat dari LPM STIKAS SYS.

Pelaksanaan AMI ini sendiri memiliki 3 ruang lingkup sasaran yaitu:

• 24 Standar Nasional Pendidikan Tinggi

• 8 Standar Perguruan Tinggi

• Unit Kerja di Lingkungan STIKAS-SYS

Diharapkan AMI Siklus Il ini memberi hasil terbaik, dan dapat ditindaklanjuti oleh para pemangku kepentingan terkait.