STIKAS-SYS didirikan oleh Rm. Yohanes Indrakusuma, CSE, pendiri Kongregasi Putri Karmel, Kongregasi Carmelitarum Sancti Eliae dan Komunitas Tritunggal Mahakudus. STIKAS-SYS adalah seminari tinggi yang mengutamakan pendidikan integral bagi religius, calon imam, dan awam untuk menghasilkan tenaga pastoral yang profesional yang memiliki pengetahuan iman, terampil, berkeutamaan, dan iman yang hidup